ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم دوروم ( Triticum turgidum var. durum) با استفاده از نشانگرهای رتروترانسپوزونی (SSAP)

Authors

  • نقوی, محمد رضا
  • حسین زاده, عبدالهادی
  • رشیدی منفرد, سجاد
  • مردی, محسن
  • پیرسیدی, سید مصطفی
Abstract:

The genetic diversity of major crops, including durum wheat, has suffered an overall reduction with time. The knowledge of patterns of genetic diversity enhances the efficiency of germplasm conservation and improvement. In this study, 87 Iranian landraces of Triticum turgidum var. durum originating from different geographical areas of Iran, along with 21 durum cultivars from ten countries were evaluated using ten primer combination SSAP markers. Retrotransposons are mobile genetic elements that transpose via RNA mediation. They have wide distributions in genome because molecular markers have been designed based on them in recent years. SSAP markers BARE-1,Thv19, Tagermina and Tar1 were also used. Thv19M+ACA primer combination had the most polymorphic band in both landraces and cultivar durum wheats. Approximately 26.7 % BARE-1 bands were polymorphic in landraces.Thv19 showed a polymorphism level of 51.5%, and Tar1 and Tagermina displayed polymorphism levels of 32.8% and 27.2%, respectively. The amount of polymorphism in the studied cultivars for retrotransposons BARE1, Tagermina, Thv19 and Tar1 were 24.4%, 24.3%, 51.5%, 28.5%, respectively. This results show that Thv19 and Tar1 have more transpositional activity in the evolutionary process. Finally, Dendrogram was constructed to use algorithm UPGMA and Dice similarity coefficients.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم دوروم (<i> triticum turgidum</i> var. durum) با استفاده از نشانگرهای رتروترانسپوزونی (ssap)

تنوع ژنتیکی گیاهان زراعی اصلی همانند گندم دوروم با گذشت زمانی کاهش پیدا کرده است. ارزیابی تنوع ژنتیکی در کارایی حفاظت از ژرم پلاسم و کاربرد آن حائز اهمیت می باشد. در این مطالعه 87 ژنوتیپ بومی دوروم متعلق به مناطق مختلف ایران و 21 ژنوتیپ خارجی از 10 کشور با استفاده از 10 ترکیب آغازگری ssap ارزیابی شدند. رتروترانسپوزون ها توالی های متحرک در داخل ژنوم می باشند که از طریق یک rna حدواسط در داخل ژنوم...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی نمونه های گندم دوروم (Triticum turgidum) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

در این تحقیق تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم گندم دوروم (Triticum turgidum ssp. durum) با استفاده از توالی های ساده تکراری (ریزماهواره‌ها) ارزیابی شد. یکصد و چهل ژنوتیپ متعلق به مناطق مختلف (10 کشور) با 48 جفت نشانگر ریزماهواره (با پوشش یکنواخت ژنوم) مورد بررسی قرار گرفتند و از این تعداد، 37 جفت نشانگر چند شکلی نشان دادند. در مجموع از 37 جفت نشانگر، 245 آلل چند شکل متفاوت، در دامنه ای بین 2 تا 17 آلل و ب...

full text

مطالعه واکنش به باززایی از جنین نارس در ارقام گندم دوروم Triticum turgidum var. durum)

Immature embryo culture response of 28 durum wheat (Triticum turgidum var. durum) cultivars was studied using MS medium in Tissue Culture Laboratory of College of Agriculture, Isfahan University of Technology. Donor plants were grown in a recirculating hydroponic system and pots in a greenhouse. Regenerated immature embryos were recorded at 2, 4, 8 and 16 days after inoculation. Assessment of d...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی نمونه های گندم دوروم (triticum turgidum) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

در این تحقیق تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم گندم دوروم (triticum turgidum ssp. durum) با استفاده از توالی های ساده تکراری (ریزماهواره ها) ارزیابی شد. یکصد و چهل ژنوتیپ متعلق به مناطق مختلف (10 کشور) با 48 جفت نشانگر ریزماهواره (با پوشش یکنواخت ژنوم) مورد بررسی قرار گرفتند و از این تعداد، 37 جفت نشانگر چند شکلی نشان دادند. در مجموع از 37 جفت نشانگر، 245 آلل چند شکل متفاوت، در دامنه ای بین 2 تا 17 آلل و ب...

full text

ارزیابی تحمل به شوری در ارقام گندم دوروم(Triticum turgidum var. durum) تحت شرایط این ویترو

In vitro salt tolerance of 28 cultivars of durum wheat with native and exotic origins was investigated, using MS medium containing sodium chloride. The resulting calli were subjected to 8 salinity levels including 0, 0.3, 0.6, 0.9, 1.2, 1.5 and 1.8 percent NaCl (w/v). Donor plants of explant (immature embryo) were grown in a recirculating hydroponics and pots in a greenhouse as well as in the f...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 12  issue 45

pages  147- 155

publication date 2008-10

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023